Tiền thân công ty cổ phần Dược Phẩm Thiên Dược là công ty TNHH Thiên Dược thành lập vào ngày 27/04/2007 tại Tp.Hồ Chí Minh. Để tạo điều kiện phát triển sản xuất kinh doanh bền vững và lâu dài, Công ty Thiên Dược đã chuyển trụ sở chính và nhà máy sản xuất về lô F3, đường N5, Khu công nghiệp Nam Tân Uyên, phường Khánh Bình, thị xã Tân Uyên, Tỉnh Bình Dương.

Ngày 27/05/2010, nhà máy sản xuất thuốc của Công ty Thiên Dược đã được Cục Quản lý dược - Bộ Y tế cấp giấy chứng nhận đạt tiêu chuẩn GMP-WHO (Thực hành tốt sản xuất thuốc), GLP (Thực hành tốt phòng kiểm nghiệm thuốc), GSP (Thực hành tốt bảo quản thuốc).
Ngày 03/07/2019 chuyển từ công ty TNHH Thiên Dược thành công ty cổ phần dược phẩm Thiên Dược.